Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vamp1Q62442 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp1Q62442 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms