Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa13Q62424 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hoxa13Q62424 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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