Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SypQ62277 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SypQ62277 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SypQ62277 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SypQ62277 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SypQ62277 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SypQ62277 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SypQ62277 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SypQ62277 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SypQ62277 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SypQ62277 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SypQ62277 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SypQ62277 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SypQ62277 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SypQ62277 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SypQ62277 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SypQ62277 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SypQ62277 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SypQ62277 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SypQ62277 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SypQ62277 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SypQ62277 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SypQ62277 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SypQ62277 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SypQ62277 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SypQ62277 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SypQ62277 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms