Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttf1Q62187 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf1Q62187 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf1Q62187 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms