Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema3cQ62181 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sema3cQ62181 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms