Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3bQ62177 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3bQ62177 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms