Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbm38Q62176 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbm38Q62176 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms