Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aldh1a2Q62148 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aldh1a2Q62148 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms