Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd1Q62101 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd1Q62101 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms