Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Odf1Q61999 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Odf1Q61999 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf1Q61999 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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