Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fscn1Q61553 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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Fscn1Q61553 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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Fscn1Q61553 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fscn1Q61553 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms