Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccne1Q61457 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccne1Q61457 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccne1Q61457 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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