Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd53Q61451 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd53Q61451 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms