Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PcolceQ61398 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PcolceQ61398 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms