Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AcanQ61282 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AcanQ61282 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AcanQ61282 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AcanQ61282 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AcanQ61282 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AcanQ61282 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AcanQ61282 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AcanQ61282 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms