Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpc6Q61143 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Trpc6Q61143 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Trpc6Q61143 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Trpc6Q61143 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trpc6Q61143 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpc6Q61143 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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