Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cln3Q61124 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cln3Q61124 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms