Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxf1Q61080 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxf1Q61080 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxf1Q61080 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxf1Q61080 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxf1Q61080 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxf1Q61080 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxf1Q61080 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms