Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxg1Q60987 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxg1Q60987 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms