Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JrkQ60976 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms