Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis1Q60954 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Meis1Q60954 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms