Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DbpQ60925 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DbpQ60925 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DbpQ60925 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms