Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf8Q60846 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf8Q60846 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms