Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp1r1bQ60829 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r1bQ60829 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms