Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp3Q60770 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp3Q60770 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stxbp3Q60770 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms