Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P4ha1Q60715 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P4ha1Q60715 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P4ha1Q60715 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms