Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samhd1Q60710 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms