Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sin3aQ60520 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sin3aQ60520 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sin3aQ60520 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms