Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a3Q5XF89 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a3Q5XF89 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms