Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd5Q5VCS6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms