Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf1Q5U4C3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf1Q5U4C3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf1Q5U4C3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms