Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdcp1Q5U462 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdcp1Q5U462 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms