Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NotoQ5TIS6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NotoQ5TIS6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms