Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Trim38Q5SZ99 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Trim38Q5SZ99 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Trim38Q5SZ99 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Trim38Q5SZ99 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Trim38Q5SZ99 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Trim38Q5SZ99 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Trim38Q5SZ99 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Trim38Q5SZ99 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trim38Q5SZ99 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim38Q5SZ99 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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