Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r196Q5SVD5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms