Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Sco1Q5SUC9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Sco1Q5SUC9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Sco1Q5SUC9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Sco1Q5SUC9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Sco1Q5SUC9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Sco1Q5SUC9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sco1Q5SUC9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sco1Q5SUC9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 289.8 ms