Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TefmQ5SSK3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms