Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRX1

Tom1l2, TOM1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l2Q5SRX1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tom1l2Q5SRX1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tom1l2Q5SRX1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms