Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh12Q5RJH3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdh12Q5RJH3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms