Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlha9Q5RJB0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms