Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsrp1Q5NCR9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsrp1Q5NCR9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsrp1Q5NCR9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsrp1Q5NCR9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsrp1Q5NCR9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsrp1Q5NCR9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsrp1Q5NCR9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsrp1Q5NCR9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsrp1Q5NCR9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsrp1Q5NCR9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms