Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Rapgef6Q5NCJ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rapgef6Q5NCJ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rapgef6Q5NCJ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rapgef6Q5NCJ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms