Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim58Q5NCC9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim58Q5NCC9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim58Q5NCC9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms