Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf2Q5NC05 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttf2Q5NC05 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttf2Q5NC05 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms