Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZK1

Cep44, Centrosomal protein of 44 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep44Q5HZK1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep44Q5HZK1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep44Q5HZK1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms