Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ecm2Q5FW85 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ecm2Q5FW85 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ecm2Q5FW85 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms