Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpm3Q5F4S9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trpm3Q5F4S9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm3Q5F4S9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms