Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc3Q5DU56 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Nlrc3Q5DU56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlrc3Q5DU56 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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