Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ndufaf2Q59J78 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ndufaf2Q59J78 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms