Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn3Q499D0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms